Изобретение относится к области медицинских технологий, связанных со сбором, хранением и переработкой крови. Способ предусматривает установку участка полимерной трубки, находящегося в непосредственной близости от места ее ввода в контейнер, между двумя плоскими поверхностями, одна из которых акустически связана с источником ультразвуковых колебаний, сжатие трубки до касания ее противоположных внутренних поверхностей, ультразвуковое воздействие до перехода материала трубки в вязкопластичное состояние и формирование шва. При этом, после размещения участка подводящей полимерной трубки между двумя плоскими поверхностями подают электрическое напряжение на обмотку электромагнита от генератора электрических колебаний ультразвуковой частоты, настроенного на рабочую частоту, более высокую, чем собственная частота механических колебаний ультразвуковой колебательной системы. В процессе сжатия трубки осуществляют перестройку частоты генератора на более низкую, приближают рабочую частоту генератора к собственной резонансной частоте колебательной системы, преобразуют электрические колебания в упругие ультразвуковые при совпадении частот генератора и колебательной системы и формируют термический шов, затем перестройкой генератора уменьшают частоту и прекращают ультразвуковое воздействие, продолжая подавать электрическое напряжение от генератора на обмотку магнита до стабилизации герметизирующего шва, причем скорость изменения рабочей частоты генератора электрических колебаний ультразвуковой частоты в заданном диапазоне устанавливается в зависимости от типа герметизируемого контейнера. Способ позволяет обеспечить надежную герметизацию всех типов существующих гемоконтейнеров отечественного и зарубежного производства.